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上海文庙建于清咸丰五年，经历了将近3年的时间的修缮，于1999年10月重新对外开放。文庙中轴线上有棂星门、大成门、两庑、大成殿等建筑，这是当年儒士们拜祭孔老夫子的线路，因此又被称为祭孔线。在儒学线上重建了学门、仪门、明伦堂、尊经阁等古建筑，重现文庙儒学线的建制；其东侧以天光云影池为中心的庙园线，重建了儒学署，使魁星阁更现魁星舞笔点状元的古韵。

元代始建的文庙，位于学宫街，1853年（清咸丰三年）上海小刀会起义，在文庙设指挥部，清军攻陷上海县城，文庙被炮火所毁。
1855年（清咸丰五年）文庙在现址重建，占地17亩。内有棂星门、泮池、三顶桥、大成殿、崇圣祠、明伦堂、尊经阁、魁星阁等建筑；有放生池、荷花池等景点；隙地遍种花木。当时已初具规模，但以后渐趋式微，犹如一颗明珠沉落于灰土之中。解放后，人民政府拨款重修，并列为文物保护单位。在“文革”期间，又遭到严重破坏。但改革开放以后，政府拨款修葺和重建了一批建筑和景点，使文庙初步恢复原貌。
1995年根据“以旧区改造为重点，以道路建设和旅游为先导”的发展战略，南市区制定了文庙修缮、开发的方案，决定采取整体规划、分步实施的方法，争取三年内完成。